Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tvp23bQ9D8T4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tvp23bQ9D8T4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tvp23bQ9D8T4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms