Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8Q6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8Q6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms