Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop56Q9D6Z1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nop56Q9D6Z1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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