Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnbd2Q9D5U8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnbd2Q9D5U8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnbd2Q9D5U8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnbd2Q9D5U8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnbd2Q9D5U8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms