Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PudpQ9D5U5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms