Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph14Q9D3W1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rsph14Q9D3W1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rsph14Q9D3W1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms