Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Obox1Q9D350 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Obox1Q9D350 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms