Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700034E13RikQ9D2T6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700034E13RikQ9D2T6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms