Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mms19Q9D071 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mms19Q9D071 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms