Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab3bQ9CZT8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms