Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CYI0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CYI0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CYI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CYI0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CYI0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CYI0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms