Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bud23Q9CY21 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bud23Q9CY21 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bud23Q9CY21 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms