Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Raver1Q9CW46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Raver1Q9CW46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raver1Q9CW46 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms