Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lhfpl3Q9CTN8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lhfpl3Q9CTN8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms