Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms