Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rdm1Q9CQK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rdm1Q9CQK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rdm1Q9CQK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms