Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.7 ms