Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bap1Q99PU7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bap1Q99PU7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bap1Q99PU7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms