Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt23Q99PS0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms