Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr3Q99MB1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr3Q99MB1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms