Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CsprsQ99388 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CsprsQ99388 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms