Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh2b1Q91ZM2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms