Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc12Q8K5B8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc12Q8K5B8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms