Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1Q8K193 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms