Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbrd1Q8K0B2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmbrd1Q8K0B2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms