Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms