Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc21aQ8C0S4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc21aQ8C0S4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21aQ8C0S4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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