Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctdsp2Q8BX07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms