Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rd3Q8BRE0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms