Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc1bQ8BH88 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc1bQ8BH88 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Depdc1bQ8BH88 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms