Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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