Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt12Q8BG71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt12Q8BG71 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms