Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctdspl2Q8BG15 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdspl2Q8BG15 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms