Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnpo1Q8BFY9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnpo1Q8BFY9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.2 ms