Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chsy1Q6ZQ11 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy1Q6ZQ11 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy1Q6ZQ11 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy1Q6ZQ11 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy1Q6ZQ11 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy1Q6ZQ11 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms