Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tfap2eQ6VUP9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2eQ6VUP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2eQ6VUP9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms