Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt9Q6RHW0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt9Q6RHW0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt9Q6RHW0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.6 ms