Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc4Q6PHQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pabpc4Q6PHQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms