Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23ipQ6NZC7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23ipQ6NZC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23ipQ6NZC7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms