Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpsf6Q6NVF9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpsf6Q6NVF9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms