Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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TroQ6DIC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TroQ6DIC6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TroQ6DIC6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TroQ6DIC6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TroQ6DIC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms