Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh2Q64221 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlh2Q64221 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlh2Q64221 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms