Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vat1Q62465 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vat1Q62465 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vat1Q62465 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms