Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema5aQ62217 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema5aQ62217 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms