Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkciQ62074 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkciQ62074 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkciQ62074 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms