Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift20Q61025 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift20Q61025 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms