Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Neurod1Q60867 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Neurod1Q60867 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Neurod1Q60867 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms