Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stxbp3Q60770 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stxbp3Q60770 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stxbp3Q60770 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stxbp3Q60770 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp3Q60770 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp3Q60770 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp3Q60770 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp3Q60770 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.9 ms