Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gprasp1Q5U4C1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gprasp1Q5U4C1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gprasp1Q5U4C1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gprasp1Q5U4C1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gprasp1Q5U4C1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gprasp1Q5U4C1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gprasp1Q5U4C1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms