Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav3-3Q5R1C3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms